При Дніпропетровській медичній академії існує чотири Спеціалізовані вчені ради по захисту кандидатських і докторських дисертацій:
- Спеціалізована вчена рада Д 08.601.01 із захисту докторських дисертацій за спеціальностями:
- 14.01.03 – хірургія;
- 14.01.24 – лікувальна фізкультура та спортивна медицина
- 14.01.30 – анестезіологія та інтенсивна терапія.
- Спеціалізована вчена рада Д 08.601.02 із захисту кандидатських і докторських дисертацій за спеціальностями:
- 14.01.10 – педіатрія;
- 14.01.11 – кардіологія;
- 14.01.36 – гастроентерологія.
- Спеціалізована вчена рада Д 08.601.03 із захисту докторських дисертацій за спеціальностями:
- 14.01.21 – травматологія та ортопедія;
- 14.03.01 – нормальна анатомія;
- 14.03.09 – гістологія, цитологія, ембріологія.
- Спеціалізована вчена рада Д 08.601.04 із захисту докторських дисертацій за спеціальностями:
- 14.01.01 – акушерство та гінекологія;
- 14.01.22 – стоматологія
Спеціалізовані вчені ради із захисту дисертацій на здобуття ступеня доктора філософії
З метою подальшого удосконалення планування НДР, дисертаційних робіт, контролю виконання та ефективності впровадження отриманих результатів в практику охорони здоров’я при Державному закладі «Дніпропетровська медична академія Міністерства охорони здоров’я України» функціонують ряд проблемних комісій, які є постійно діючим органом, що здійснює наукову оцінку, прогнозування й координацію наукових досліджень та забезпечує їх виконання відповідними кадрами.
З моменту свого заснування в 1916 р., ДДМУ є одним з фундаментальних центрів вищої медичної освіти і науки в Україні і Східній Європі.
Комісія з питань біомедичної етики створена для надання консультативної допомоги й здійснення контролю забезпечення етичних та морально-правових аспектів під час проведення клінічних випробувань за участю людей та досліджень із залученням лабораторних тварин при виконанні науково-дослідних й дисертаційних робіт у Державному закладі «Дніпропетровська медична академія Міністерства охорони здоров’я України».
Студентське наукове товариство ДДМУ нараховує 38 наукових гуртків, що охоплюють понад 400 студентів. Це створює умови для творчої діяльності, набуття впевненості у своїх можливостях опанування науковими матеріалами, в досягненні необхідних професійних якостей.